Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms