Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms