Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3b1Q9Z1T1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms