Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr5Q9Z1P4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr5Q9Z1P4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms