Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms