Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn9Q9Z0S7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn9Q9Z0S7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn9Q9Z0S7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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