Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn13Q9Z0S4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn13Q9Z0S4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn13Q9Z0S4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn13Q9Z0S4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms