Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cib1Q9Z0F4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib1Q9Z0F4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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