Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx1Q9WV80 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms