Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms