Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpc2Q9R244 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms