Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept6Q9R1T4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms