Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NrkQ9R0G8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms