Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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