Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nufip1Q9QXX8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms