Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms