Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms