Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr5Q9JLF7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr5Q9JLF7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms