Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nectin3Q9JLB9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nectin3Q9JLB9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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