Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms