Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms