Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd3Q9JJY3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms