Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfra4Q9JJT2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfra4Q9JJT2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms