Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Bco1Q9JJS6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Bco1Q9JJS6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Bco1Q9JJS6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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