Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Cldn19Q9ET38 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Cldn19Q9ET38 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Cldn19Q9ET38 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Cldn19Q9ET38 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn19Q9ET38 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Cldn19Q9ET38 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Cldn19Q9ET38 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Cldn19Q9ET38 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Cldn19Q9ET38 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cldn19Q9ET38 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cldn19Q9ET38 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cldn19Q9ET38 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn19Q9ET38 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Cldn19Q9ET38 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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