Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms