Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp3a44Q9EQW4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms