Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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