Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xab2Q9DCD2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms