Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrpraQ9DBG7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms