Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Med27Q9DB40 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms