Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph3bQ9DA80 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms