Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms