Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd8Q9DA37 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Samd8Q9DA37 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Samd8Q9DA37 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Samd8Q9DA37 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Samd8Q9DA37 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Samd8Q9DA37 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Samd8Q9DA37 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd8Q9DA37 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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