Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdzd9Q9D9M4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd9Q9D9M4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms