Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl40Q9D783 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms