Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms