Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms