Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms