Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms