Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tmem53Q9D0Z3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tmem53Q9D0Z3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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