Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms