Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7aQ9CZ04 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cops7aQ9CZ04 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cops7aQ9CZ04 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cops7aQ9CZ04 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cops7aQ9CZ04 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops7aQ9CZ04 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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