Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms