Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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