Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf1Q9CWX2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms