Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Khdc3Q9CWU5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Khdc3Q9CWU5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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