Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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