Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fcf1Q9CTH6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fcf1Q9CTH6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fcf1Q9CTH6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fcf1Q9CTH6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Fcf1Q9CTH6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Fcf1Q9CTH6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Fcf1Q9CTH6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Fcf1Q9CTH6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Fcf1Q9CTH6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Fcf1Q9CTH6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Fcf1Q9CTH6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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