Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PclafQ9CQX4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PclafQ9CQX4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms